يقول الدكتور محمد الشرقاوي استشاري الباطنة أنه ومن أسباب حدوث أمراض الجهاز العصبي الذاتي ما يلي:
اضطراب الأوعية الدموية، والتي تؤدي إلى حدوث مشاكل في تدفق الدم نحو الدماغ والأجزاء العصبية الأخرى.
إصابات الرأس والعمود الفقري.
أيضا أمراض الجهاز العصبي الوراثية والخلقية.
وأسباب ومشاكل الصحة العقلية، مثل الاكتئاب الحاد، واضطرابات القلق، والذهان.