تشرح الدكتورة آمال التهامي استشاري الباطنة أنه يمكن تقسيم القرحة الهضمية إلى 3 أنواع رئيسية، وذلك بناء على حسب موقع الإصابة بالقرحة، وهي كالآتي:
قرحة المعدة، حيث تتطور القرحة داخل جدار المعدة.
قرحة المريء، والتي تظهر فيها التقرحات في البطانة التي تغطي الجزء السفلي من المريء.
قرحة الاثني عشر، وهي القرحة التي تتطور في الجزء العلوي من الأمعاء الدقيقة، والذي يسمى بالاثني عشر.
كما يمكن أن تصنف القرحة الهضمية إلى عدة أنواع، وذلك حسب الظروف المسببة لتكون القرحة، وهي ما يلي:
القرحة الهامشية، والتي تنتج عند إزالة جزء من المعدة جراحيًا، وتحديدًا في المنطقة التي يتم وصل الأطراف المتبقية من المعدة فيها.
القرحة التوترية، والتي تحدث نتيجة الإجهاد والتوتر المرتبط بالإصابة بالمرض الحاد أو عند الإصابة بحروق، أو أي أصابات أخرى. يمكن لهذا النوع من القرحات الهضمية أن تظهر في المعدة أو الإثني عشر.